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#r 语言

自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘

R语言,linux及服务器远程配置

生信老学长

嗨,生信同路人,我是生信老学长。上阵杀敌,十八般武器总要会使上两门,赤手空拳不是大师就是大尸。一般来说,在常用的语言中我建议从R语言入门,相较于python和M...

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各种文件的介绍和读取--基于R

生信老学长

生信老学长1、CSV文件“师兄,为什么我读取xlsx总是报错?”,“师兄,怎么我的文件表头不见了?”,看着师弟那渴望知识的眼神,你却目光躲闪?来了,来了,生信老...

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Nature 系列都提醒过的坑:为什么你的富集分析显著通路太多?

生信小博士

说实话,这个坑连Nature 系列都提醒过。 富集分析不只是比p值小,而是比“背景”真实。 选错背景,p值再小也没意义。 一行代码,让结果从玄学变科学。

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Science|单细胞2.0时代来了:Perturb-seq在体应用首秀!

生信小博士

Cell首发:单细胞 × CRISPR = Perturb-seq,机制研究神器!

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Nature系列|免疫浸润分析使用ssGSEA、GSVA都可以吗

生信小博士

为什么它们能用于“免疫浸润”? “免疫浸润”本质是细胞组成与活性在转录层面的影子。若有“某免疫细胞特异高表达的一组基因”(签名),那这组基因在一个样本里整体越靠...

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别怪GO/KEGG太假,其实是你富集分析的“背景基因”没设!

生信小博士

生信小博士 最近看到太多“假显著”的富集结果了,动不动几百上千个通路全显著。 看起来丰富,其实大多数是背景设错的“统计幻觉”。 这篇就讲清楚——为什么很多生信公...

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LASSO回归 没有筛出变量咋办

生信小博士

✅ RNA-seq 需要 log2 转换,否则 LASSO 会受到极端值影响。 ✅ 如果 LASSO 没选出变量,可以:

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单细胞测序数据分析标准流程详解

生信小博士

以上代码演示了一个典型的10x单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的聚类分析流程,从数据预处理一直到降维和聚类。每一步骤都或多或少会对后续细胞聚类的效果以...

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三组数据还用ANOVA?你的统计可能从一开始就错了!

生信小博士

你在处理三组或三组以上数据时,是否也曾机械地打开GraphPad,直接勾选“Ordinary one-way ANOVA”?

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救命!谁审的稿子又在乱用t检验?!

生信小博士

g Senescent cells were co-stained by SPiDER SA-β Gal, and the LIVE/DEAD Near-IR ...

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10.11-补 R03-04

用户10407460

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R中P值很小的情况如何解决?

用户11845082

我用的limma包进行的差异分析,但是在做火山图的时候,发现了异常值,就是存在了P值无限接近0的基因,这使得我有点不知所措,看了一篇博主对此的解释谈谈那些R处理...

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告别低效:构建健壮R爬虫的工程思维

华科云商小徐

作为常年用R搞数据抓取的老手,我一度自信能轻松搞定任何网站。但说实话,我踩过的坑比爬取的页面还多。我曾固执地认为rvest加选择器就是万能钥匙,直到在动态内容面...

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一文看懂 Mantel 相关性连线图:万物互联 X与Y的关联原来这么可视化!

生信探索

Mantel 检验是一种用于评估两个矩阵之间相关性的统计方法,主要应用于生态学研究中。它的核心思想是:

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2025-08-04 r语言学习

用户11775359

R软件的优点,对比网页,有很多参数可调整(可结合想达到的图片,咨询ai需要设置什么参数 要求给代码)

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